- Oggetto:
- Oggetto:
I. MICROBIOLOGIA SPECIALE E TECNICHE DIAGNOSTICHE (D.M. 270/04)
- Oggetto:
MICROBIOLOGY AND DIAGNOSTIC TECHNIQUES
- Oggetto:
Anno accademico 2016/2017
- Codice dell'attività didattica
- MED 2885
- Docente
- Dott. Chiara MERLINO (Docente Responsabile del Corso Integrato)
- Corso di studi
- [f070-c711] TECNICHE DI LABORATORIO BIOMEDICO (ABILITANTE ALLA PROFESSIONE SANITARIA DI TECNICO DI LABORATORIO BIOMEDICO)
- Anno
- 3° anno
- Tipologia
- --- Nuovo Ordinamento ---
- Crediti/Valenza
- 8
- SSD dell'attività didattica
- MED/07 - microbiologia e microbiologia clinica
MED/46 - scienze tecniche di medicina e di laboratorio - Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Obbligatoria
- Tipologia d'esame
- Scritto ed orale
- Prerequisiti
- Insegnamenti 1° - 2° anno
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Al termine del corso gli studenti avranno acquisito le conoscenze relative alla patogenesi delle principali malattie infettive con il relativo approfondimento delle caratteristiche morfologiche e di virulenza dei più importanti microrganismi patogeni (batteri, miceti, virus e parassiti). A corso terminato gli studenti avranno infine acquisito conoscenze sulla diagnosi di laboratorio (manuale ed automatizzata), sulla profilassi e sui principi di terapia delle malattie ad eziologia batterica, fungina, virale e parassitaria.
At the end of the course, students will have acquired knowledge about the epidemiology and pathogenesis of the major infectious diseases with the study of virulence characteristics of the most important pathogenic microorganisms (bacteria, fungi, virus and parasites). Finally, students will have acquired knowledge about laboratory diagnosis, prophylaxis and treatment of bacterial, fungal, viral and parasitic diseases.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Lo studente dovrà:
- aver acquisito le conoscenze relative alla patogenesi delle principali malattie infettive e alla profilassi e i principi di terapia delle malattie ad eziologia batterica e fungina;
- aver acquisito le principali nozioni di parassitosi umane con riferimenti di epidemiologia;
- aver acquisito le conoscenze di base di virologia con particolare riguardo alle diagnosi di laboratorio;
- aver appreso i differenti principi strumentali utilizzati all’interno dei laboratori di microbiologia ad elevata automazione.
Students will achieve:
- knowledge about the pathogenesis of the major infectious diseases and the prophylaxis and treatment of the bacterial and fungal infections.
- knowledge about parasitic diseases and epidemiology.
- knowledge about viruses and related diseases in particular about laboratory diagnosis.
- knowledge of the technical principles used in microbiology labs with high automation.
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
L’Insegnamento si articola in quattro moduli:
Virologia generale e speciale: prevede 36 ore di lezione (3 CFU)
Microbiologia speciale: prevede 24 ore di lezione (2 CFU)
Parassitologia e malattie infettive:prevede 12 ore di lezione (1 CFU)
Scienze tecniche: microbiologia diagnostica: prevede 24 ore di lezione (2 CFU)
Le lezioni dell’insegnamento si articolano in 96 ore totali di didattica frontale, che si svolgono in aula con l’ausilio di proiezioni.
The course is divided in:
Generale and Medical Virology: 36 hours (3 credits)
Microbiology: 24 hours (2 credits)
Parasitology and Infectious Diseases: 12 hours (1 credit)
Diagnostic Microbiology: 24 hours (2 credits)
TOTAL: 96 hours, lessons are supported by slides and videos.
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
Virologia generale e Speciale: Orale, 2 domande (1 Virologia Generale e Diagnostica, 1 Virologia Speciale)
Microbiologia Speciale: Orale, 2 domande
Scienze Tecniche: Microbiologia Diagnostica: Scritto, 5 domande aperte
Parassitologia e Malattie Infettive: Scritto, 40 domande a scelta multipla (0,5 punti per ogni domanda corretta, 5 risposte errate -1 punto) e 2 domande aperte (5 punti caduna).
Voto finale espresso in trentesimi come media ponderata rispetto ai CFU dei 4 moduli.
General and Medical Virology: Oral examination, 2 questions (1 about General Virology, 1 about Medical and Diagnostic Virology.
Microbiology: Oral examination, 2 questions
Diagnostic Microbiology: Written examination, 5 questions.
Parasitology: Written examination, 40 multiple choice questions (0.5/answer; 5 wrong answers = -5) plus 2 questions (5/question).
Final evaluation: Weighted Average according to credits/single course. Grades expressed as x/30
- Oggetto:
Attività di supporto
Frequenza in laboratorio di Virologia Diagnostica a gruppi di 7 studenti per 4 ore/studente. Viene illustrato l’iter diagnostico dall’arrivo del campione alla refertazione dell’esame eseguito riguardo alla diagnostica virologica classica (isolamento virale su colture cellulari e identificazione mediante immunofluorescenza indiretta con anticorpi monoclonali, dimostrazione diretta di antigeni virali), di viroimmunologia (dimostrazione della risposta cellulo-mediata antivirale specifica), virologia molecolare (multiplex-PCR per l’amplificazione di sequenze geniche di virus respiratori).
Student’ groups (7 students/group, 4 hours/student) attends the Diagnostic Virology lab. They follow the diagnostic pathway of the clinical sample from a diagnostic virological point of view: classical diagnosis by virus isolation in cell cultures and identification by IFI with monoclonal antibodies, direct detection of viral antigens, immunovirology (detection of specific cell-mediated immune response), molecular virology (multiplex-PCR to amplify gene sequences of respiratory
- Oggetto:
Programma
Virologia generale e speciale
- Proprietà generali dei virus. Replicazione virale. Coltivazione dei virus animali. Elementi di genetica virale.
- Patogenesi delle infezioni virali.
- Tecniche di diagnostica virologica
Azione patogena con particolare riguardo alla localizzazione dei virus ed al prelievo dei campioni biologici per la diagnosi di laboratorio di:
- virus a DNA (Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papovaviridae, Hepadnavirus, Parvoviridae).
- virus ad RNA (Orthomixoviridae, Paramixoviridae, Rhabdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Calciviridae, Astrovirus, Filoviridae, Birnaviridae)
Microbiologia speciale
Batteri Gram-positivi: Genere Staphylococcus:morfologia, caratteristiche colturali, fattori di virulenza (esotossine e esoenzimi). S. aureus e S. epidermidis: quadri clinici, diagnosi; resistenza agli antibiotici. Genere Streptococcus:morfologia, classificazione, esotossine, esoenzimi. S. pyogenes, S. agalactiae, streptococchi orali, enterococchi, S. pneumoniae:patogenesi e diagnosi. Corynebacterium spp(C. diphteriae):caratteristiche, patologia, diagnosi, profilassi e terapia. Listeria monocytogenes: caratteristiche, coltivazione, patogenesi, quadri clinici e diagnosi.
Batteri Gram-positivi sporigeni: Genere Bacillus (B. anthracis, B. cereus): morfologia, identificazione, patogenesi, profilassi e terapia.Genere Clostridium (C. tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile): morfologia, identificazione, quadri clinici, diagnosi, terapia e profilassi.
Batteri Gram-negativi: Enterobacteriaceae (E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,.Yersinia spp.):morfologia, classificazione, quadri clinici e relativa diagnosi. Vibrioni (Vibrio cholerae): caratteristiche, identificazione, enterotossina, patogenesi, diagnosi e terapia. Pseudomonas aeruginosa: quadri clinici e diagnosi. Neisserie spp (N. gonorrhoeae, N. meningitidis): caratteristiche morfologiche e colturali, patogenesi, quadri clinici, diagnosi differenziale. Haemophilus spp. (H. influenzae, H. parainfluenzae, H. ducrey):caratteristiche, identificazione e manifestazioni cliniche. Bordetella spp. (B. pertussis), Brucella spp., Legionella spp.:quadri clinici e diagnosi. Campylobacter spp., Helicobacter pylori:caratteristiche, patogenesi e diagnosi.
Micobatteri: morfologia, tassonomia. M. tuberculosis:caratteristiche tintoriali e colturali, patogenesi, diagnosi e terapia. M. leprae: caratteristiche, quadri clinici e diagnosi.
Micoplasmi:caratteristiche morfologiche e colturali. Mycoplasma pneumoniae, M. genitalium, M. hominis, Ureaplasma spp: quadri clinici e diagnosi.
Spirochete (generi Treponema, Borrelia e Leptospira): caratteristiche principali, quadri clinici causati dalle specie patogene, diagnosi batteriologica e sierologia, terapia.
Clamidie:caratteristiche, quadri clinici causati daC. trachomatis, C. psittaci, C. pneumoniae e relativa diagnosi.
Miceti: caratteristiche dei lieviti e funghi filamentosi. Micosi cutanee, sottocutanee e micosi sistemiche. Micosi opportunistiche. Candida albicans: caratteristiche principali, relativiquadri clinici e diagnosi. Dermatofiti: caratteristiche, manifestazioni cliniche e diagnosi. Aspergilli: caratteristiche, quadri clinici e diagnosi.
Parassitologia e malattie infettive
Parassitologia Generale/Parassitologia Speciale: Epidemiologia, Ciclo Biologico, Morfologia e Tecniche Diagnostiche di:
Protozoi: amebe, flagellati, ciliati, coccidi, sporozoi
Entamoeba hystolitica/dispar, Entamoeba coli, Iodamoeba butschlii, Endolimax nana, Naegleria, Acanthamoeba, Blastocystis hominis, Giardia lamblia, Balantidium coli, Isospora belli, Cyclosposa cayetanensis, cryptosporidium parvum, microsporidi, Trichomonas vaginalis, Toxoplasma gondii, Plasmodi (falciparum, vivax, ovale, malariae), Babesia, Leishmanie,(donovani, infamtum, tropica), Tripanosomi (gambiense, rhodesiense, cruzi)
ELMINTI: PLATELMINTI CESTODI Taenai saginata, Taenia solium, (Teniosi, Cisticercosi) Diphillobotrium latum, Echinococcus granulosus, Hymenolepis nana, Hymenolopis diminuta
PLATELMINTI TREMATODI Schistosoma mansoni, Schistosoma japonicum, Schistosoma haematobium Fasciola epatica, Fasciolopsis buski, Clonorchis sinensis, Paragonimus westermani
NEMATODI Ascaris lumbricoides Trichuris trichiura, Enterobius vermicularis Trichinella spiralis, Strongyloides stercoralis, Ancylostoma duodenalis / Necator americanus, Toxocara canis, Wucherereria bancrofti Brugia malaii Loa loa Mansonella ozzardi Onchocerca volvulus, Dracunculus medinensis, Dirofilaria
ARTROPODI
Pidocchi Pediculus humanus capitis, corporis, Phthirus pubis
Pulci, Zecche: Argasidae, Ixodidae Sarcoptes scabiaei, Demodex folliculorum, Dermanyssus gallinae
Scienze tecniche: microbiologia diagnostica
-Funzione del laboratorio di microbiologia
-Caratteristiche del rapporto ospite-parassita :esempi di colonizzazione, adesione, invasione e disseminazione.
-Sangue : batteriemia, sepsi (SIRS), sepsi severa, shock settico. Ruolo dell’emocolture, brodi di coltura e dosaggio PCT.
-Strumenti per emocolture: differenti principi analitici delle apparecchiature attualmente in commercio ( sistemi : fluorimetrico, colorimetrico, radiometrico, impedenziometrico).
-Indagini microbiologiche su punte di catetere.
-Identificazioni batteriche attraverso i sistemi “Multipli”(tipo API) e lettore per sistemi a “galleria”.
-Enterotube.
-Cenni alla tecnica di semina : isolamento miceti e batteri.
-Ruolo del laboratorio di microbiologia nelle indagini per Fibrosi Cistica.
-Antibiogramma manuale : Kirby-Bauer
-ETEST
-Presentazione dei concetti base dell’utilizzo dei valori soglia Breakpoint, valori di ECOFF,
-Wilde Type secondo sistema EUCAST ( interpretazione ATB).
-Infezioni nosocomiali : principali localizzazioni delle infezioni e microrganismi responsabili (iter diagnostico dalla raccolta alla refertazione del campione).
-Sistemi ad Automazione variabile e completa : esempi di strumentazione attualmente in uso e funzioni di ciascun modulo .
-Principi di lettura in automazione : fotometria-fluorimetria.
-Esempi di antibiogramma ed antimicogramma secondo i sistemi automatizzati.
-Letture di MIC turbidimetrica nelle diverse apparecchiature.
-Funzione dei software “dedicati” a strumenti ad automazione completa.
-Test automatizzati per la diagnosi rapida delle batteriurie.
-Spettrometria di massa: procedimento, Target plate, disgregazione, ionizzazione, desorbimento campione.
VIROLOGY: Stucture, morphology, classification and general properties of viruses. Strategies and steps of viral replication. Animal viruses culture methods. Principle of viral genetics. Virus-host interactions. Viral pathogenesis. Virological diagnosis: approaches and methods
Pathogenesis, clinical signs and virological diagnosis of the infections caused by:
DNA viruses(Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papovaviridae, Hepadnavirus, Parvoviridae) and RNA viruses (Orthomixoviridae, Paramixoviridae, Rhabdoviridae, Retroviridae, Picornaviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae, Arenaviridae, Coronaviridae, Calciviridae, Astrovirus, Filoviridae, Birnaviridae)
MICROBIOLOGY. description of the order, taxonomy, clinical diseases, bacteriological and serological diagnosis, therapy of:Gram-positive bacteria: Staphylococcus: S. aureus, S. epidermidis. Streptococcus: S. pyogenes, S. agalactiae, oral streptococci, enterococci, S. pneumoniae. Corynebacterium (C. diphteriae). Listeria monocytogenes. Spore-forming Gram-positive bacteria: Bacillus:B. anthracis, B. cereus. Clostridium: C. tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile. Gram-negative bacteria: Enterobacteriaceae: E. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Salmonella spp., Shigella spp,, Yersinia spp.. Vibrio: Vibrio cholerae. Pseudomonas aeruginosa. Neisseria: N. gonorrhoeae, N. meningitidis. Haemophilus: H. influenzae, H. parainfluenzae and H. ducrey. Bordetella, Brucella, Legionella: Campylobacter: C. jejuni, C. coli. Helicobacter pylori. Mycobacteria: M. tuberculosis and M. leprae. Mycoplasmas and Ureaplasmas:M. pneumoniae, M. genitalium, M. hominis. U. urealyticum. Spirochetales(Treponema, Borrelia and Leptospira). Chlamydia: C. trachomatis, C. psittaci, C. pneumoniae.
Mycetes: Candida albicans, dermatophytes and aspergilli.
PARASITOLOGY AND INFECTIUOS DISEASES: general parasitology, special parasitology: epidemiology, life cycle, morphology and diagnostic methods. protozoa: amoeba, flagellati, ciliati, coccidi, sporozoa: Entamoeba hystolitica/dispar, Entamoeba coli, Iodamoeba butschlii, Endolimax nana, Naegleria, Acanthamoeba, Blastocystis hominis, Giardia lamblia, Balantidium coli, Isospora belli, Cyclosposa cayetanensis, cryptosporidium parvum, microsporidi, Trichomonas vaginalis, Toxoplasma gondii, Plasmodi (falciparum, vivax, ovale, malariae), Babesia, Leishmanie,(donovani, infamtum, tropica), Tripanosomi (gambiense, rhodesiense, cruzi). Helminths: plathelminthes cestoidean: Taenia saginata, Taenia solium, (Teniosi, Cisticercosi) Diphillobotrium latum, Echinococcus granulosus, Hymenolepis nana, Hymenolopis diminuta. Plathelminthes trematoda Schistosoma mansoni, Schistosoma japonicum, Schistosoma haematobium Fasciola epatica, Fasciolopsis buski, Clonorchis sinensis, Paragonimus westermani. Nematoda: Ascaris lumbricoides Trichuris trichiura, Enterobius vermicularis Trichinella spiralis, Strongyloides stercoralis, Ancylostoma duodenalis / Necator americanus, Toxocara canis, Wucherereria bancrofti Brugia malaii Loa loa Mansonella ozzardi Onchocerca volvulus, Dracunculus medinensis, Dirofilaria. Arthropods: Pediculus humanus capitis, corporis, Phthirus pubis. Pulex. Ticks: Argasidae, Ixodidae Sarcoptes scabiaei, Demodex folliculorum, Dermanyssus gallinae
DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY
- Function of the microbiology laboratory
- Characteristics of the host-parasite relationship: examples of colonization, adhesion, invasion, and dissemination.
- Blood : bacteremia, sepsis (SIRS ), severe sepsis, septic shock . Role of blood culture, culture broths and PCT dosage.
- Blood culture tools: different analytical principles of the equipment currently on the market .
- Microbiological investigations of catheter tips.
- Bacterial identification using the "Multiples" (type API ) system and "gallery" systems reader.
- Enterotube.
- Technique of sowing: the isolation of fungi and bacteria.
- Role of the microbiology lab in the investigation for Cystic Fibrosis.
- Manual antibiogram: Kirby -Bauer
- ETEST
- Presentation of the conceptsabout the use of the threshold Breakpoint values, ECOFF values, the Wilde Type according to EUCAST (ATB interpretation).
- Nosocomial infections : main localization of infections and causative organisms (diagnostic process from collection to publication of the results) .
- Systems of variable and complete automation: examples of instrumentation currently in use and functions of each module.
- Principles of fluorescence - photometric - radiometric reading.
- Examples of antibiogram and antifungal sensibility test according to automated systems.
- MIC turbidimetric readings in different equipment .- Function of software "dedicated" to complete automation tools.
- Automated testing for the rapid diagnosis of bacteriuria-Mass spectrometry : procedure- MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption/ionization-time of fligt mass spectrometry)
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Virologia generale e speciale
Principi di virologia medica - Antonelli e Clementi Casa Editrice Ambrosiana Virologia medica - Dianzani MC GRAW-HILL Editore
Microbiologia speciale
Cevenini R., Sembri V. - Microbiologia e microbiologia clinica, PICCIN
Parassitologia e malattie infettive
Ivo De Carneri: parassitologia generale e umana Casa editrice ambrosiana Milano
Siti internet:
http://www.k-state.edu/parasitology/546tutorials/titlepage.html
http://www.k-state.edu/parasitology/625tutorials/index.html
http://www.cdfound.to.it/html/atlas.htm
Scienze tecniche: microbiologia diagnostica
Manuali strumentali forniti dalle Ditte delle singole apparecchiature illustrate a lezione.
-Bugiardini e brochure allegati ai materiali di consumo degli strumenti presentati nelle singole lezioni.
-“Medicina di Laboratorio-Principi di tecnologia –Microbiologia Clinica” di A.Burlina.
-“Diagnostica e Tecniche di Laboratorio” (Batteriologia) di F.Pasquinelli
-“Microbiologia clinica” di Roberto Cevenini-PICCIN-seconda edizione2010
-“Test Atlante di Microbiologia Diagnostica”-Elmer W.Koneman- Delfino editore- seconda edizione
VIROLOGY: Principi di virologia medica - Antonelli e Clementi Casa Editrice Ambrosiana Virologia medica - Dianzani MC GRAW-HILL Editore
MICROBIOLOGY: Cevenini R., Sembri V. - Microbiologia e microbiologia clinica, PICCIN
PARASITOLOGY: Ivo De Carneri: parassitologia generale e umana Casa editrice ambrosiana Milano
Siti internet http://www.k-state.edu/parasitology/546tutorials/titlepage.html
http://www.k-state.edu/parasitology/625tutorials/index.html
http://www.cdfound.to.it/html/atlas.htm
DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY:
Instrumental manuals provided by the companies of the single equipment described in class.
- Leaftlet and brochure attached to consumables of the tools presented in individual lessons .
- " Laboratory Medicine - Principles of Technology- Clinical Microbiology " - A.Burlina .
- "Diagnostics and Laboratory Techniques " ( Bacteriology ) - F.Pasquinelli
- " Clinical Microbiology " - Roberto Cevenini - PICCIN - second edition 2010
- "Test Atlas of Diagnostic Microbiology " - Elmer W.Koneman – Delfino Publisher - second edition- Oggetto:
Note
1° SEMESTRE
- Oggetto:
Moduli didattici
- Microbiologia speciale (D.M. 270/04) (MED 2885B)
- Parassitologia e malattie infettive (D.M.270/04) (MED 2885C)
- Scienze Tecniche: Microbiologia Diagnostica (D.M.270/04) (MED 2885D)
- Virologia Generale e Speciale (D.M.270/04) (MED 2885A)
- Oggetto: